MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 51164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013740	CGCC	2	8	199092	199099	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4502	NC_013740	ATA	2	6	199131	199136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_013740	ATGG	2	8	199149	199156	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013740	CCGG	2	8	199159	199166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_013740	AGC	2	6	199236	199241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047553
4506	NC_013740	A	6	6	199271	199276	100 %	0 %	0 %	0 %	284047553
4507	NC_013740	G	6	6	199366	199371	0 %	0 %	100 %	0 %	284047553
4508	NC_013740	ATCT	2	8	199406	199413	25 %	50 %	0 %	25 %	284047553
4509	NC_013740	TCT	2	6	199430	199435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047553
4510	NC_013740	CAT	2	6	199459	199464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047553
4511	NC_013740	CTGG	2	8	199585	199592	0 %	25 %	50 %	25 %	284047553
4512	NC_013740	ATC	2	6	199604	199609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047553
4513	NC_013740	TAT	2	6	199625	199630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047553
4514	NC_013740	CAT	2	6	199633	199638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047553
4515	NC_013740	CGG	2	6	199650	199655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4516	NC_013740	TTC	2	6	199658	199663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047553
4517	NC_013740	GGT	2	6	199756	199761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047553
4518	NC_013740	CTG	2	6	199784	199789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047553
4519	NC_013740	GCG	2	6	199811	199816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4520	NC_013740	GGGGCC	2	12	199832	199843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4521	NC_013740	CTG	2	6	199859	199864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047553
4522	NC_013740	CTC	2	6	199865	199870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047553
4523	NC_013740	TTC	2	6	199901	199906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047553
4524	NC_013740	CCGG	2	8	199946	199953	0 %	0 %	50 %	50 %	284047553
4525	NC_013740	ATC	2	6	199958	199963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047553
4526	NC_013740	GCCCTG	2	12	199976	199987	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284047553
4527	NC_013740	TGC	2	6	200010	200015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047553
4528	NC_013740	ATG	2	6	200036	200041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047553
4529	NC_013740	CGG	2	6	200051	200056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4530	NC_013740	TGG	2	6	200061	200066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047553
4531	NC_013740	G	6	6	200065	200070	0 %	0 %	100 %	0 %	284047553
4532	NC_013740	CCA	2	6	200088	200093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047553
4533	NC_013740	CCA	2	6	200142	200147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047553
4534	NC_013740	CGG	2	6	200154	200159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4535	NC_013740	GGC	2	6	200254	200259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4536	NC_013740	GCA	2	6	200277	200282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047553
4537	NC_013740	GGC	2	6	200300	200305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4538	NC_013740	GGC	2	6	200311	200316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4539	NC_013740	TCC	2	6	200409	200414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047553
4540	NC_013740	GCG	2	6	200459	200464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4541	NC_013740	TGC	2	6	200475	200480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047553
4542	NC_013740	TCC	2	6	200519	200524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047553
4543	NC_013740	CGC	2	6	200551	200556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047553
4544	NC_013740	TTC	2	6	200570	200575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047553
4545	NC_013740	A	6	6	200579	200584	100 %	0 %	0 %	0 %	284047553
4546	NC_013740	AGC	2	6	200610	200615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047553
4547	NC_013740	GCG	2	6	200651	200656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047553
4548	NC_013740	GGGGT	2	10	200683	200692	0 %	20 %	80 %	0 %	284047553
4549	NC_013740	TGGCCG	2	12	200715	200726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284047553
4550	NC_013740	GAA	3	9	200771	200779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047553
4551	NC_013740	TGG	2	6	200811	200816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047553
4552	NC_013740	GAA	2	6	200824	200829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047553
4553	NC_013740	TGT	2	6	200838	200843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047553
4554	NC_013740	A	6	6	200844	200849	100 %	0 %	0 %	0 %	284047553
4555	NC_013740	T	6	6	200884	200889	0 %	100 %	0 %	0 %	284047554
4556	NC_013740	TTCTTT	2	12	200892	200903	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284047554
4557	NC_013740	CAC	2	6	200904	200909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047554
4558	NC_013740	CAG	2	6	200913	200918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047554
4559	NC_013740	TC	3	6	200989	200994	0 %	50 %	0 %	50 %	284047554
4560	NC_013740	TTC	2	6	200997	201002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047554
4561	NC_013740	CAG	2	6	201003	201008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047554
4562	NC_013740	CATC	2	8	201074	201081	25 %	25 %	0 %	50 %	284047554
4563	NC_013740	CCGG	2	8	201107	201114	0 %	0 %	50 %	50 %	284047554
4564	NC_013740	GGC	2	6	201126	201131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047554
4565	NC_013740	GCC	3	9	201145	201153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047554
4566	NC_013740	ACC	2	6	201157	201162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047554
4567	NC_013740	CTT	2	6	201224	201229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047554
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4569	NC_013740	GCCG	2	8	201243	201250	0 %	0 %	50 %	50 %	284047554
4570	NC_013740	TCA	2	6	201311	201316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047554
4571	NC_013740	GCA	2	6	201419	201424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047555
4572	NC_013740	C	6	6	201497	201502	0 %	0 %	0 %	100 %	284047555
4573	NC_013740	TTC	2	6	201513	201518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047555
4574	NC_013740	CCA	3	9	201557	201565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047555
4575	NC_013740	CAG	2	6	201663	201668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047555
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4577	NC_013740	TA	3	6	201705	201710	50 %	50 %	0 %	0 %	284047555
4578	NC_013740	CAG	2	6	201754	201759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047555
4579	NC_013740	CCA	2	6	201767	201772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047555
4580	NC_013740	CAG	2	6	201840	201845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047555
4581	NC_013740	GGGCA	2	10	201855	201864	20 %	0 %	60 %	20 %	284047555
4582	NC_013740	GTCC	2	8	201935	201942	0 %	25 %	25 %	50 %	284047555
4583	NC_013740	G	6	6	201974	201979	0 %	0 %	100 %	0 %	284047555
4584	NC_013740	TGC	2	6	201982	201987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047555
4585	NC_013740	GAT	2	6	201999	202004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047555
4586	NC_013740	GCAG	2	8	202097	202104	25 %	0 %	50 %	25 %	284047555
4587	NC_013740	CCG	2	6	202147	202152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047555
4588	NC_013740	TTGGCT	2	12	202162	202173	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284047555
4589	NC_013740	CAT	2	6	202217	202222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047555
4590	NC_013740	GTG	2	6	202246	202251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047555
4591	NC_013740	GCG	2	6	202351	202356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047555
4592	NC_013740	CAT	2	6	202421	202426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047555
4593	NC_013740	CA	3	6	202476	202481	50 %	0 %	0 %	50 %	284047555
4594	NC_013740	GGAG	2	8	202493	202500	25 %	0 %	75 %	0 %	284047555
4595	NC_013740	GAA	2	6	202515	202520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047555
4596	NC_013740	ATA	2	6	202554	202559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284047555
4597	NC_013740	CCT	2	6	202624	202629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_013740	CCAA	2	8	202633	202640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_013740	GCA	2	6	202673	202678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047556
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4601	NC_013740	ATC	2	6	202917	202922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047556
4602	NC_013740	GCA	2	6	202939	202944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047556
4603	NC_013740	GAT	2	6	203055	203060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047556
4604	NC_013740	GA	3	6	203100	203105	50 %	0 %	50 %	0 %	284047556
4605	NC_013740	ATG	2	6	203125	203130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047556
4606	NC_013740	CCA	2	6	203216	203221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047556
4607	NC_013740	GGA	2	6	203222	203227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047556
4608	NC_013740	T	7	7	203238	203244	0 %	100 %	0 %	0 %	284047556
4609	NC_013740	TCT	2	6	203269	203274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047556
4610	NC_013740	TTG	2	6	203299	203304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047556
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4612	NC_013740	A	6	6	203427	203432	100 %	0 %	0 %	0 %	284047556
4613	NC_013740	CCA	2	6	203435	203440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047556
4614	NC_013740	CCA	2	6	203495	203500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047556
4615	NC_013740	GCC	2	6	203587	203592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047556
4616	NC_013740	GCC	2	6	203599	203604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047556
4617	NC_013740	CTTC	2	8	203606	203613	0 %	50 %	0 %	50 %	284047556
4618	NC_013740	CA	3	6	203649	203654	50 %	0 %	0 %	50 %	284047556
4619	NC_013740	T	6	6	203661	203666	0 %	100 %	0 %	0 %	284047556
4620	NC_013740	TGG	2	6	203707	203712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047556
4621	NC_013740	TCA	2	6	203846	203851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047556
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4623	NC_013740	TGA	2	6	203879	203884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4870	NC_013740	GGA	2	6	214403	214408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4871	NC_013740	GCA	2	6	214452	214457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047566
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4873	NC_013740	GCT	2	6	214604	214609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
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4973	NC_013740	TCA	3	9	219375	219383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047571
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4979	NC_013740	CTGAC	2	10	219588	219597	20 %	20 %	20 %	40 %	284047571
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4989	NC_013740	GCA	2	6	220017	220022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047571
4990	NC_013740	CCG	2	6	220098	220103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047572
4991	NC_013740	CTG	2	6	220118	220123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047572
4992	NC_013740	CCA	2	6	220222	220227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047572
4993	NC_013740	GTG	2	6	220232	220237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047572
4994	NC_013740	CTG	2	6	220277	220282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047572
4995	NC_013740	CCCGG	2	10	220285	220294	0 %	0 %	40 %	60 %	284047572
4996	NC_013740	TGA	2	6	220326	220331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047572
4997	NC_013740	CGG	2	6	220368	220373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047572
4998	NC_013740	ATG	2	6	220374	220379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047572
4999	NC_013740	ACC	2	6	220409	220414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047572
5000	NC_013740	CGG	2	6	220428	220433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047572

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